GPCR是人体内最大的膜蛋白家族,也是最重要的药物靶点。传统药物主要通过结合内源性配体的“正构位点”发挥作用。然而,这种方式常因位点保守性导致选择性差、副作用大,且难以修复由功能缺失(LoF)突变引起的受体功能障碍,留下了巨大的治疗空白。自然界中存在一些跨膜调控蛋白,然而针对GPCR跨膜域进行功能导向的蛋白质从头设计,仍是一片未被探索的“无人区”。
针对上述挑战,浙江大学人工智能学院章敏团队联合基础医学院张岩团队,建立了一套基于生成式人工智能的探针算法(图a),以及一个“类幻觉”的蛋白质从头设计流程(图b)。


团队利用高通量结构预测,结合扩散模型、图消息传递网络等算法,定位了潜在的跨膜调控位点;并创新性地提出了三种“结构提示(Structural Prompting)”策略,在迭代优化过程中施加结构功能约束,引导生成具有特定结合模式和功能的跨膜蛋白。
团队从头设计的靶向G蛋白偶联受体(GPCR)跨膜结构域的外骨骼蛋白,简称GEM,是一种可编程的蛋白工具,能够对受体功能进行调控和拯救(图c),为GPCR别构调节和结构生物学研究提供了新工具,也为传统药物无法靶向的遗传性疾病开辟了极具前景的治疗路径。

该成果于2026年2月17日在《Nature》(自然)期刊发表题为“De novo Design of GPCR Exoframe Modulators”的研究论文,并受到新华社、人民网、浙江新闻等多家主流媒体的广泛报道。
论文原文链接:
Shizhuo Cheng, Jia Guo, Yun-li Zhou, Xumei Luo, Gufang Zhang, Ya-zhi Zhang, Yixin Yang, Jiannan Xie, Ping Xu, Dan-dan Shen, Shaokun Zang, Huicui Yang, Xuechu Zhen, Min Zhang & Yan Zhang. De novo design of GPCR exoframe modulators. Nature651, 242–250 (2026).